MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 plasmid pYV03

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017565	AT	3	6	87	92	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017565	T	6	6	92	97	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017565	GTT	2	6	112	117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017565	CTT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017565	CTTTT	2	10	169	178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017565	TAAA	2	8	186	193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017565	GCCC	2	8	235	242	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017565	CAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017565	TTA	2	6	321	326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017565	ACA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017565	TCA	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017565	CA	3	6	367	372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017565	GCC	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017565	TAG	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017565	GGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017565	AACCGG	2	12	670	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017565	AAT	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017565	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017565	GAGCA	2	10	1163	1172	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017565	CCA	2	6	1198	1203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017565	TGT	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017565	AGA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017565	T	8	8	1390	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017565	AT	3	6	1419	1424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017565	AAT	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017565	GTG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017565	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017565	GATA	2	8	3953	3960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017565	AT	3	6	6685	6690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017565	AAT	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017565	TTA	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017565	A	6	6	6757	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017565	TA	4	8	6768	6775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017565	CAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017565	TAT	2	6	6856	6861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017565	T	6	6	6951	6956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017565	ACT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017565	TCG	2	6	7102	7107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017565	TAA	3	9	7116	7124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017565	AGAA	2	8	7137	7144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017565	AATA	2	8	7229	7236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017565	AAT	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017565	TTCT	2	8	8310	8317	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017565	TGCC	2	8	8350	8357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017565	GAA	2	6	8361	8366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017565	GGT	2	6	8440	8445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017565	AAAG	2	8	8483	8490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017565	ATT	2	6	8565	8570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017565	GTA	2	6	8583	8588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017565	ATT	2	6	8707	8712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017565	AT	3	6	8723	8728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017565	ATC	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017565	ATC	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017565	ACT	2	6	10563	10568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017565	TAA	2	6	10598	10603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017565	ACTC	2	8	10628	10635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017565	ATT	2	6	10736	10741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017565	GTA	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017565	AT	3	6	10768	10773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017565	ATT	2	6	10775	10780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017565	TAT	2	6	10808	10813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017565	AACAT	2	10	10844	10853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017565	TAA	2	6	10880	10885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017565	A	6	6	10906	10911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017565	ACA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017565	AAT	2	6	11049	11054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017565	AAT	2	6	12624	12629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017565	T	6	6	12632	12637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017565	AGC	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017565	AAT	2	6	12896	12901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017565	A	6	6	13344	13349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017565	TTA	2	6	13387	13392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017565	GTC	2	6	13432	13437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017565	GGCT	2	8	13511	13518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017565	TA	3	6	13554	13559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017565	C	6	6	14221	14226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_017565	TGG	2	6	14235	14240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017565	ATT	2	6	14677	14682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017565	TA	3	6	14692	14697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017565	GAA	2	6	14705	14710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017565	AC	3	6	14783	14788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017565	TAA	2	6	14828	14833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017565	CGAC	2	8	16099	16106	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017565	GTT	2	6	16166	16171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017565	GCG	2	6	16179	16184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017565	AGA	2	6	16198	16203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017565	A	6	6	16263	16268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017565	T	6	6	16328	16333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017565	CT	3	6	16377	16382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017565	TTA	2	6	16437	16442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017565	T	8	8	16448	16455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017565	T	6	6	16459	16464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017565	GA	3	6	16465	16470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017565	G	6	6	16472	16477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017565	TAA	2	6	16478	16483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017565	A	8	8	16486	16493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017565	AATA	2	8	16503	16510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017565	T	6	6	16518	16523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017565	T	7	7	16528	16534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017565	TATGTT	2	12	16536	16547	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017565	TGAGG	2	10	16611	16620	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017565	T	9	9	16623	16631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017565	CGA	2	6	16690	16695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017565	ACG	2	6	16709	16714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017565	AGT	2	6	16724	16729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017565	AT	3	6	16736	16741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017565	T	6	6	16763	16768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017565	TAAT	2	8	16832	16839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017565	AT	3	6	16838	16843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017565	CGATTA	2	12	18357	18368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017565	TAA	2	6	19271	19276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017565	TAT	2	6	19288	19293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017565	TTA	2	6	19346	19351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017565	TGAT	2	8	19402	19409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017565	AAAAC	2	10	19505	19514	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017565	TCAT	2	8	19548	19555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017565	CCAT	2	8	19600	19607	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017565	TCA	2	6	19648	19653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017565	TTTAT	2	10	19681	19690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017565	CTT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017565	TA	3	6	19752	19757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017565	T	7	7	19763	19769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017565	ACCG	2	8	21100	21107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017565	AAGT	2	8	21139	21146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017565	CGT	2	6	21267	21272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017565	GCG	2	6	21282	21287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017565	ATA	2	6	21312	21317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017565	TCA	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017565	AAT	2	6	23555	23560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017565	CA	3	6	23799	23804	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017565	T	6	6	23895	23900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017565	TGT	2	6	23941	23946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017565	AG	3	6	23966	23971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017565	GAA	2	6	23972	23977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017565	A	6	6	24742	24747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017565	GCG	2	6	25033	25038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017565	GGA	2	6	25183	25188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017565	GAA	2	6	25214	25219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017565	CGA	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017565	TAA	2	6	26084	26089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017565	T	6	6	26127	26132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017565	CAC	2	6	26493	26498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017565	A	6	6	26591	26596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017565	T	6	6	26659	26664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017565	GAG	2	6	26703	26708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017565	ATA	2	6	27692	27697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017565	ACTG	2	8	27721	27728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017565	T	6	6	27739	27744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017565	TA	3	6	27798	27803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017565	CTG	2	6	27814	27819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_017565	TTA	3	9	65509	65517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017565	CTG	2	6	65785	65790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.